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  1. 2013.11.13 하플로그룹 (Haplogroup)이란?
  2. 2013.09.16 Y-chromosome haplogroups 세계지도
  3. 2011.04.05 하플로그룹 (Haplogroup) 이란?
  하플로그룹(Haplogroup)은 분자진화 연구에서의 단상형 유전자(haplotype, Greekαπλούςhaploûs, "onefold, single, simple")들의 큰 집단으로 염색체의 특정 위치에 있는 일련의 대립유전자들이다.
  인류 유전학에서 가장 많이 연구되는 하플로그룹은 Y 염색체 DNA 하플로그룹과 미토콘드리아 DNA(mtDNA) 하플로그룹으로, 유전 집단을 정의하는 데에 사용될 수 있다. Y-DNA는 부계를 통해서만, mtDNA는 모계를 통해서만 전달된다.


  위 내용은 위키백과에 있는 하플로그룹의 정의 입니다.
 

  하플로그룹은 동일한 하플로타입(haplotype)끼리 묶어 그룹으로 분류한 것이라고 생각하면 됩니다. 다르게 표현하면 하플로그룹은 공유하는 돌연변이에 의해 정의되는 서열의 연관된 그룹을 나타내며지역적 특이성을 보이는 경향이 있습니다. 하플로타입은 반수체(haploid) 유전자를 조사했을 때 나타난 변이를 하나의 타입으로 본 것입니다. 변이는 주로 단일염기다형성(SNP, Single nucleotide polymorphism)을 이용하며, 삽입결실(InDel, Insertion/Deletion)다형이 포함되기도 합니다. 어떤 변이를 조사했는지에 따라서 다양한 방법으로 하플로그룹을 구성할 수 있겠지만, 집단유전학에서는 다양한 하플로타입을 조사하여 계층적으로 분류하고 특정한 변이에 대한 하플로그룹이 지정되어 있습니다.


   같은 하플로타입을 가지면 같은 공통 조상을 공유하고 있다는 것을 의미합니다. 따라서 개인의 SNP 변이를 조사했을 때 같은 하플로타입으로 조사된다면 같은 조상의 후손이라는 의미입니다. 하플로그룹은 Y염색체의 하플로그룹과 mtDNA 하플로그룹 두 가지를 많이 연구합니다. 위 위키백과의 정의에 나온 것과 마찬가지로, Y염색체 하플로그룹이 동일하면 동일 부계 혈통이라는 의미이며, 같은 mtDNA 하플로그룹에 속하면 동일한 모계 혈통이라고 볼 수 있습니다. 


  하플로그룹을 이용한 혈통 분류는 큰 그룹으로 나눈 것이기 때문에 (같은 하플로그룹의 조상은 수천년~수만년 전에 형성됨), 같은 집안 사람끼리 동일한 하플로그룹에 속할 수는 있지만, 같은 하플로그룹을 갖는다고 하여서 같은 집안이라고 보기는 힘듭니다. 아직까지는 하플로그룹만으로 이처럼 세부적인 구분이 힘들지만, 민족(집단)을 구성하는 하플로그룹은 집단이나 지역에 따라 다르기 때문에, 하플로그룹을 조사함으로써 어떤 민족(집단)인지 추정할 수 있습니다. 이를 이용하여 집단의 기원, 인류의 이동경로 (Genographic project) 등을 연구하고 있습니다.





- 자료 출처 : 위키백과 (http://ko.wikipedia.org/wiki/하플로그룹), 

                  Wikipedia (http://en.wikipedia.org/wiki/Haplogroup), 

                  FT-DNA (http://www.familytreedna.com/)


- 이 글은 생명과학 블로그 (http://biosci.tistory.com/26)에 동일하게 올라가 있습니다.

Posted by 토리군

Dienekes's 블로그에 Wikipedia에 올라온 Y-DNA haplogroup 세계지도 가 포스팅되었는데~

처음 본 직후에는 우와~!!! 했는데...

자세히 보니 그게 아니네요...



저 블로그에서도 얘기했지만...

일부 집단을 제외하고는 다양한 그룹이 섞여있기 때문에

저렇게 표기하는건 표현도 힘들 뿐 아니라 잘못되었다고 생각됩니다.


그리고 우리나라가 중국과 같은 O3e 라니...

우리는 중국이랑 같은색인데 일본은 다르다니...

중국에서 만들었나? 하는 생각도 드네요.


아직 한국인 집단에 대해서 연구할 것도 많은데...

중국은 1,000 genomes project 데이터를 이용해서 새로운 동아시아인의 Y-haplogroup을 발굴하고 있던데요.

우리나라 일부 과학자들은 이미 다 되서 할 게 없다고 생각하고 있으니 안타깝네요.

한편으로는 동북공정 같은곳에 활용되지 않을까 걱정되기도 하고요.



앞으로 한국인에 대해서 더 깊게 연구할 수 있는 날이 오기를 기대하며~

이전에 조사했던 한국인의 Y-haplogroup 빈도표를 올려봅니다.^^


Population

(n)

C

 

D

L

N

O1

 

O2

 

O3

Q

R

C1

C3

D2

O1a

O2*

O2b*

O2b1

O3*

O3a*

O3a3

O3a4

Korean

(506)

1
(0.20)

63
(12.45)

8
(1.58)

3
(0.59)

23
(4.55)

11
(2.17)

5
(0.99)

114
(22.53)

45
(8.89)

2
(0.40)

5
(0.99)

146
(28.85)

71
(14.03)

7
(1.38)

2
(0.40)

(자료 출처 : Kim et al., Investigative Genetics 2011, 2:10, 일부 하플로그룹은 최근에 명칭이 변경되었을 수 있습니다. 분석에 이용한 변이를 알면 확인 가능합니다. 각 하플로그룹의 분석에 이용한 변이는 논문을 참고하세요.)



Posted by 토리군
  하플로그룹(Haplogroup)은 분자진화 연구에서의 단상형 유전자(haplotype, Greek: απλούς, haploûs, "onefold, single, simple")들의 큰 집단으로 염색체의 특정 위치에 있는 일련의 대립유전자들이다.
  인류 유전학에서 가장 많이 연구되는 하플로그룹은 Y 염색체 DNA 하플로그룹미토콘드리아 DNA(mtDNA) 하플로그룹으로, 유전 집단을 정의하는 데에 사용될 수 있다. Y-DNA는 부계를 통해서만, mtDNA는 모계를 통해서만 전달된다.

  위 내용은 위키백과에 있는 하플로그룹의 정의 입니다.
 

모든 분자들은 조상형 하플로그룹의 일부이다. 그러나 어떤 시점에 돌연변이 A가 조상의 분자에서 나타나고, 새로운 계통이 만들어진다. 이것이 하플로그룹 A가 되고, 돌연변이 A에 의해 정의된다. 더 최근 시점의 과거에, 하플로그룹 A에 포함되는 사람에서 새로운 돌연변이 B가 나타나며 하플로그룹 B로 정의된다. 하플로그룹 B는 하플로그룹 A의 하위그룹 또는 하위계통이다. 하플로그룹 A와 B는 모두 조상형 하플로그룹의 하위계통이다. (Hg=Haplogroup)

  하플로그룹은 동일한 하플로타입(haplotype)끼리 묶어 그룹으로 분류한 것이라고 생각하면 됩니다. 하플로타입은 반수체(haploid) 유전자를 조사했을 때 나타난 변이를 하나의 타입으로 본 것입니다. 변이는 주로 단일염기다형성(SNP, Single nucleotide poly morphism)을 이용하며, 삽입결실(InDel, Insertion/Deletion)다형이 포함되기도 합니다. 어떤 변이를 조사했는지에 따라서 다양한 방법으로 하플로그룹을 구성할 수 있겠지만, 집단유전학에서는 다양한 하플로타입을 조사하여 계층적으로 분류하고 특정한 변이에 대한 하플로그룹이 지정되어 있습니다.

   같은 하플로타입을 가지면 같은 공통 조상을 공유하고 있다는 것을 의미합니다. 따라서 개인의 SNP 변이를 조사했을 때 같은 하플로타입으로 조사된다면 같은 조상의 후손이라는 의미입니다. 하플로그룹은 Y염색체의 하플로그룹과 mtDNA 하플로그룹 두 가지를 많이 연구합니다. 위 위키백과의 정의에 나온 것과 마찬가지로, Y염색체 하플로그룹이 동일하면 동일 부계 혈통이라는 의미이며, 같은 mtDNA 하플로그룹에 속하면 동일한 모계 혈통이라고 볼 수 있습니다.

  하플로그룹을 이용한 혈통 분류는 큰 그룹으로 나눈 것이기 때문에 (같은 하플로그룹의 조상은 수천년~수만년 전에 형성됨), 같은 집안 사람끼리 동일한 하플로그룹에 속할 수는 있지만, 같은 하플로그룹을 갖는다고 하여서 같은 집안이라고 보기는 힘듭니다. 아직까지는 하플로그룹만으로 이처럼 세부적인 구분이 힘들지만, 민족(집단)을 구성하는 하플로그룹은 집단이나 지역에 따라 다르기 때문에, 하플로그룹을 조사함으로써 어떤 민족(집단)인지 추정할 수 있습니다. 이를 이용하여 집단의 기원, 인류의 이동경로 (Genographic project) 등을 연구하고 있습니다.


미토콘드리아 DNA 하플로그룹에 따른 인류의 이동경로 (FT-DNA)

Y염색체 하플로그룹에 따른 인류의 이동경로 (FT-DNA)



- 출처 : 위키백과 (http://ko.wikipedia.org/wiki/하플로그룹), Wikipedia (http://en.wikipedia.org/wiki/Haplogroup), FT-DNA (http://www.familytreedna.com/)

* 이 글은 생명과학 블로그 (http://biosci.tistory.com)에도 동일하게 올렸습니다.
Posted by 토리군